בתחילת העונה שיחקה הקבוצה במסגרת גביע אופ"א.
בסיבוב הראשון עברו הצהובים את פ.ב.ק קובנה בסיכום שני המשחקים (ניצחון ביתי 1-3 (למכבי: קוביקה (2) ובסיס) והפסד חוץ 1-2 למכבי: בסיס ) אך הודחו על ידי לאנס הצרפתית אחרי תיקו 2-2 בישראל (למכבי: קוביקה ובן דיין והפסד 2-1 בצרפת (למכבי: בסיס)
על פתיחת העונה העיבה "פרשת האפדרין" - מאמן הכושר של הקבוצה, גיא עזורי, נתן לשחקן הקבוצה כפיר אדרי לפני אחד ממשחקי הקבוצה בעונה הקודמת תוסף מזון המכיל את סם האפדרין האסור לשימוש בספורט. אדרי הורחק לשישה משחקים, ואילו הקבוצה קיבלה עונש כבד של הפחתת 4 נקודות וקנס כספי בסך 100 אלף ש"ח.
לקראת העונה התחזקה הקבוצה בישראלים לירון בסיס, חלוץ האלופה היוצאת, פליקס חלפון ובזרים גז'גוז' ודז'ינסקי ואלכסנדר קוסירין אך נאלצה להסתדר בחצי הראשון של העונה ללא אבי נמני שעזב לדרבי קאונטי מהליגה האנגלית.
לאחר חמש שנים בהן היו 16 קבוצות בליגה הבכירה, הוחלט במסגרת השינוי במערך הליגות להקטין את מספר הקבוצות בליגה על מנת להגביר את התחרותיות, ובמקום שלוש הקבוצות שירדו לליגה הלאומית שהפכה לליגת המשנה, רק מכבי נתניה עלתה לליגת העל לקראת עונה זו. הליגה כללה 14 קבוצות ששיחקו ביניהן במשך 3 סיבובים בני 13 משחקים כל אחד - 39 מחזורים בסך הכל.
כמו בכל 4 שנות הקדנציה השנייה של גרנט, פתיחת העונה הייתה לא טובה - הקבוצה פתחה עם 2 הפסדים ותיקו ב-3 המחזורים הראשונים:
מחזור 1 - הפסד 1-2 למכבי פ"ת באורווה. צימק לזכות הצהובים: קוביקה בפנדל בדקה ה-90.
מחזור 2 - תיקו מאכזב 0-0 בבית מול העולה החדשה מנתניה.
מחזור 3 - הפסד באשדוד 0-1 מרגלי שחקן הקבוצה לשעבר אלק נילאש.
במחזור ה-4 התאוששה מכבי ת"א עם 3-0 בכפ"ס (למכבי: בן דיין, קוביקה וודז'ינסקי). בכך מחקה הקבוצה את מינוס 4 הנקודות שהושת עליה בעקבות "פרשת האפדרין".
במחזור ה-5 רשמה הקבוצה תיקו 0-0 ביתי נוסף מול האלופה היוצאת הפועל חיפה.
בשני המשחקים הבאים הצליחו הצהובים לחבר רצף של 2 נצחונות:
מחזור 6 - ניצחון חוץ 1-0 על בית"ר ירושלים באצטדיון בלומפילד משער של כפיר אדרי.
מחזור 7 - הצגה גדולה בר"ג עם 0-4 מול עירוני ראשל"צ משערים של קוביקה, צמד של לירון בסיס ושער נוסף של גיא צרפתי. קפטן האורחים הורחק בכרטיס אדום.
הצהובים נעצרו במחזור ה-8 כשהפסידו להפועל פתח תקווה 1-2 עם שוויון זמני של צרפתי והרחקה של השוער לירן שטראובר.
צמרת הטבלה לאחר 8 מחזורים:
1. הפועל ת"א - 19 נק'
2. מכבי חיפה - 19 נק'
3. הפועל פ"ת - 18 נק'
מכבי ת"א הרחק מאחור במקום ה-10 מתוך 14 עם 7 נקודות בלבד.
עד לסיום הסיבוב הראשון (מחזור 11 נדחה לסיבוב השני) השיגו הצהובים 3 נצחונות ותיקו:
מחזור 9 - חגיגה בדרבי הקטן מול הכתומים-זהובים של בני יהודה עם 1-3 מצמד של דדי בן דיין ושער בפנדל של גיא צרפתי. מכבי הוליכה 0-3 כבר אחרי 33 דקות של משחק.
מחזור 10 - תיקו בדרבי הגדול מול הפועל ת"א 1-1. המגן-קשר הפולני גז'גוז' ודז'ינסקי השווה בדקה ה-17 בבעיטה אדירה לחיבורים.
מחזור 12 - ניצחון 1-0 על הפועל ירושלים משער של קוביקה.
מחזור 13 - ניצחון 0-3 על מכבי הרצליה משערים של כפיר אדרי, גיא צרפתי ודדי בן דיין. במהלך המשחק החטיא ודז'ינסקי פנדל.
בהס"כ צברה הקבוצה בסיבוב הראשון של 12 מחזורים מאזן בינוני שכלל 5 נצחונות, 4 תיקו ו-3 הפסדים ודורגה רק במקום ה-6 עם 17 נקודות - מרחק 12 נקדות מהמוליכה היריבה העירונית האדומה.
צמרת הטבלה בתום הסיבוב הראשון:
1. הפועל ת"א - 29 נק'
2. הפועל פ"ת - 28 נק'
3. מכבי חיפה - 27 נק'
4. הפועל חיפה - 23 נק'
פתיחת הסיבוב השני הייתה גרועה אף יותר עם שרשרת של 5 הפסדים רצופים מפתיחת הסיבוב:
מחזור 14 - הפסד בית 2-1 למכבי פ"ת לאחר שמכבי כבר הוליכה 0-1 משער בפנדל של קוביקה בדקה ה-7.
מחזור 11 - הפסד ביתי נוסף, 1-0 למכבי חיפה. הקבוצה נשארה ב-10 שחקנים לאחר הרחקתו של מרקו בלבול.
מחזור 15 - הפסד חוץ בקופסה 1-3. צרפתי צימק ל-1-2 אך המילה האחרונה היתה של חלוץ נתניה לירון וילנר שכבש במספרת מול שטראובר.
מחזור 16 - הפסד 2-1 למ.ס. אשדוד לאחר שמכבי כבר הוליכה 0-1 משער של ודז'ינסקי בדקה ה-15.
מחזור 17 - הפסד 1-0 להפועל כפר סבא. קוביקה יכול היה להשוות את התוצאה במחצית השניה בפנדל אך בעט למשקוף.
הרצף נעצר בניצחון חוץ גדול במחזור ה-18 4-2 (למכבי: ודז'ינסקי, בן דיין וקוביקה (2)) על האלופה האדומה מחיפה.
חמישה ימים לאחר מכן שבה הקבוצה לסורה ופתחה שוב סדרה של 4 משחקים ללא ניצחון עם הפסד ביתי במחזור ה-19 3-1 לבית"ר ירושלים (למכבי: צרפתי).משחק זה זכור על רקע פיצוץ עסקת המעבר של קפטן הירושלמים, יוסי אבוקסיס למכבי ת"א. במשחק עצמו כבש אבוקסיס בבעיטה חופשית נפלאה מ-20 מטרים לחיבורים.
מחזור 20 - תיקו 0-0 מול עירוני ראשל"צ.
מחזור 21 - הפסד 1-0 להפועל פ"ת.
מחזור 22 - תיקו 0-0 מול בני יהודה.
במחזור ה-23 פגשה מכבי את יריבתה העירונית, מוליכת הטבלה (הדאבליסטית של אותה עונה) לדרבי הגדול. דווקא במשחק זה התאוששה הקבוצה עם 0-2 של קוביקה וקוסולאפוב.
חמישה ימים לאחר מכן הקבוצה המשיכה במומנטום החיובי וחזרה מחיפה עם ניצחון על הירוקים 2-1 (למכבי: בן דיין וקוסולאפוב).
צמרת הטבלה לאחר 24 מחזורים:
1. הפועל ת"א - 57 נק'
2. מכבי חיפה - 54 נק'
3. הפועל פ"ת - 48 נק'
מכבי ת"א הרחק מאחור במקום ה-8 מתוך 14 עם 28 נקודות בלבד.
למרבה האכזבה, דווקא אחרי 2 הנצחונות היוקרתיים על 2 המוליכות, הצהובים חזרו מהר מאוד לסורם עם תיקו 1-1 עם הפועל ירושלים (למכבי: ודז'ינסקי) במחזור ה-25 והפסד 1-3 למכבי הרצליה (למכבי: פליקס חלפון) במחזור ה-26.
הסיבוב השני הסתיים עם מאזן מאכזב וגרוע שכלל רק 3 נצחונות, 3 תיקו ו-8 הפסדים ב-14 משחקים. הקבוצה דורגה במקום ה-8 עם 29 נקודות, הפרש של 28 נקודות מהיריבה העירונית שבפסגה.
לשמחתם, הצהובים קיבלו חיזוק לקראת המשך העונה בדמות שובו של אבי נמני לקבוצה לאחר שלא הצליח להשתלב באנגליה.
את הסיבוב השלישי פתחה מכבי ת"א בסערה עם 3 נצחונות רצופים:
מחזור 27 - 4-2 על מ.ס. אשדוד (למכבי: כפיר אדרי, דדי בן דיין (2) ובן לוז)
מחזור 28 - 4-2 על הפועל ירושלים (למכבי: דוד רביבו עם שער בכורה לעונה, לירון בסיס ששבר בצורת מאז המחזור ה-7, אבי נמני בבעיטה אדירה מהאויר עם שער ראשון מאז חזרתו ופליקס חלפון בפנדל)
מחזור 29 - קונצרט בצהוב עם 1-5 על עירוני ראשל"צ (למכבי: אבי נמני (2), כפיר אדרי, אלכסנדר קוסירין וגיא צרפתי)
הריצה הצהובה נעצרה בתיקו 2-2 בכפר סבא במחזור ה-30 משערים של נמני וצרפתי והפסד 2-1 לבני יהודה במחזור ה-31 כשנמני רק משווה זמנית.
הקבוצה שבה למסלול הנצחונות עם 2 נצחונות רצופים:
מחזור 32 - הצגה של 4-0 בהרצליה משערים של אבי נמני, דדי בן דיין, לירון בסיס ואלכסנדר קוסירין.
מחזור 33 - ניצחון 1-2 על מכבי נתניה משערים של אופיר חיים בשער בכורה לעונה ואלכסנדר קוסירין. נמני שובת מהבקעה לאחר שהבקיע ב-5 משחקים רצופים 6 שערים.
במחזור ה-34 התארחו הצהובים בבלומפילד לדרבי מול האדומים. דקה לתום המחצית, עלתה הפועל ת"א ליתרון 0-1 לאחר שאישטוון פישונט הקשית מעל אובארוב כדור חופשי לחיבורים. מכבי יכלה להשוות בפתיחת המחצית השנייה אך נמני החטיא פנדל. מנגד, בדקה ה-60 הכפילו האדומים את יתרונם ל-0-2 משער של סלים טועמה. שער מצמק של אלכסנדר קוסירין בדקה ה-90 קבע הפסד בדרבי 1-2.
הצהובים התאוששו כעבור שבוע במחזור ה-35 עם ניצחון גדול על הירוקי05-05ם מחיפה 0-3 משערים של פליקס חלפון בבעיטה אדירה מ-30 מטרים, גיא צרפתי בבעיטה חופשית מ-25 מטרים לאחר הרחקה של אדורם קייסי מחיפה ואבי נמני. הצהובים התנחמו לפחות בהוצאת הירוקים ממירוץ האליפות.
במחזור ה-36 סיימה הקבוצה בתיקו 2-2 עם הפועל פ"ת משערים של לירון בסיס וכפיר אדרי.
עד לסיום העונה השיגה הקבוצה 3 נצחונות רצופים:
מחזור 37 - ניצחון גדול על בית"ר ירושלים, 1-4 משערים של בן דיין (2), נמני וגדי ברומר. היה זה משחק הפרישה של השוער האגדי שורה אובארוב. לקראת סיום, כשאר כבר נגמרה מכסת החילופים, ערך המאמן גרנט מחווה מיוחדת לשוער כאשר החליט להוציאו מהמגרש לקול תשואות האוהדים שהודו לו על 9 שנים בצהוב ובמקומו נכנס לשער לא אחר מאשר אבי נמני.
מחזור 38 - ניצחון 1-0 על מכבי פ"ת משער של אופיר חיים.
מחזור 39 - ניצחון 0-1 על הפועל חיפה משער של אופיר חיים. משחק זה היה האחרון של 2 המאמנים, גרנט מצד אחד וגוטמן מצד שני בקבוצותיהם.
סה"כ השיגה הקבוצה 9 נצחונות ב-13 משחקי הסיבוב השלישי כולל על מכבי חיפה במחזור ה-35 (למכבי:חלפון, צרפתי ונמני) ו-
בסה"כ צברה הקבוצה בסיבוב השלישי מאזן טוב מאוד של 9 נצחונות, 2 תיקו ו-2 הפסדים. עקב תוצאות 2 הסיבובים הראשונים, סיימה מכבי ת"א רק במקום ה-6 בליגה, במרחק של 27 נקודות מהאלופה החדשה הפועל ת"א.
מלך השערים של הקבוצה היה המגן דדי בן דיין שכבש 11 שערי ליגה. עוד כובשים בולטים היו גיא צרפתי וקוביקה עם 9 ו-8 שערים בהתאמה. למרות שחזר רק בתחילת הסיבוב השלישי, הצליח אבי נמני לכבוש אף הוא 8 שערים ב-11 משחקים בהם שותף.
בגביע המדינה הודחו הצהובים בדרבי שמינית הגמר על ידי היריבה העירונית, הפועל ת"א, 2-0 שזכתה בגביע והשלימה זכייה בדאבל.