עקב התרסקות קבוצת ה"גלאקטיקוס" בעונה הקודמת והיכולת החלשה של הקבוצה במשחקי הליגה הוחלט לבצע שינוי בעמדת המאמן. אלי כהן הידוע בכינויו ה"שריף" מונה למאמן הקבוצה ואיתו עוזרו שחקן העבר ויקי פרץ . הקבוצה התחזקה בזרים קאלה דרשלר, מילאן מרטינוביץ', איבן רזיץ ומילאן מרדקוביץ. בגזרת הישראלים הובאו יוסי שבחון, משה ביטון ועומר פרץ ועלו מהנוער אורי שטרית שרן ייני וליאור ג'אן.
בעונה זו הקבוצה רצה בצמרת לצד יריבתה העירונית כששתיהן מנסות למנוע אליפות מבית"ר ירושלים עמוסת הכוכבים של עידן גאידמק. הקבוצה התבססה בעיקר על משחק ההגנה בראשות השוער קאלה דרשלר והשיגה רצף של 20 משחקים ללא הפסד בין המחזור ה-5 למחזור ה-25.
משחק פתיחת העונה זימן לקבוצה מפגש מול בית"ר ירושלים שנה שנייה ברציפות. למרות יכולת טובה, הפסידה הקבוצה לירושלמים 2-1 כשמרדקוביץ משווה זמנית.
רק במחזור הרביעי הצליחה הקבוצה להשיג ניצחון בכורה 0-1 על אשדוד.
במחזור ה-6 פגשה הקבוצה את בני יהודה לדרבי הקטן של ת"א. המשחק הסתיים בניצחון צהוב 0-4 גדול משערים של אבי נמני, משה ביטון, מילאן מרדקוביץ ו-ליאור ג'אן.
שבוע לאחר מכן נערך הדרבי הגדול של ת"א כשהפועל מארחת את מכבי. הצהובים אמנם פיגרו 1-0 אך השלימו מהפך וניצחו 3-1 משערים של אבי נמני, משה ביטון ואיבן רזיץ.
בסיבוב הראשון השיגה הקבוצה מאזן טוב של 6 נצחונות, 2 תיקו ו-3 הפסדים ודורגה במקום השלישי עם 20 נקודות, 3 נקודות מהירושלמים שבפסגה.
בסיבוב השני הקבוצה אמנם לא הפסידה אך השיגה מאזן פחות טוב של 3 נצחונות ו-8 תיקו אשר השאיר אותה במרחק 6 נקודות מבית"ר שבפסגה.
במחזור ה-25 אירחה מכבי ת"א את האלופה היוצאת מחיפה למשחק קריטי שניצחון בו היה מצמצם את הפער בצמרת ל-4 נקודות. אך דווקא במשחק זה הירוקים שבררו את הרצף הצהוב והנחילה לת"א הפסד 0-1. הפער צמח ל-7 נקודות.
בסופו של דבר האליפות הוכרעה בבית הדין לאחר הפחתת 2 נקודות למכבי ת"א עקב חוזים כפולים, מה שהפך את פער הנקודות (61 לבית"ר מול 50 למכבי) ל-11 נקודות 3 מחזורים לתום העונה.
לאחר שברוב העונה דורגה הקבוצה במקום השני, תבוסה במחזור הסיום בדרבי להפועל 0-3 הורידה את הצהובים למקום השלישי כשמעליה מסיימת מכבי נתניה במקום ה-2 ומתחתיה הפועל ת"א במקום ה-4 רק בשל הפרש שערים פחות טוב.
בסה"כ צברה הקבוצה בסיבוב השלישי מאזן של 5 נצחונות, 2 תיקו ו-4 הפסדים. מלך השערים של הקבוצה היה אבי נמני שנה שניה ברציפות עם 9 שערי ליגה.
בגביע המדינה הודחו הצהובים בשמינית הגמר לאחר 2-1 לבני סכנין בהארכה (למכבי: ג'ובאני רוסו).