בתחילת עונה זו שררו רוחות של ייאוש וציפיות נמוכות בקרב האוהדים. המועדון היה בגסיסה. מה לא החליפה הקבוצה: בעלים, הנהלה, צוות מקצועי, מאמן, סגל שחקנים בתקציבי עתק וכלום לא עזר. 10 שנים ללא אליפות שהיו למעשה חלק מ-17 שנים בלי מאבק אמיתי על התואר למעט ההבלחה בעונת 2002/03. אליהן הצטרפו 6 שנים רצופות של הדחות מביכות מהגביע.
הבעלים גולדהאר החליט לעשות שינוי במבנה המועדון והביא מנהל ספורטיבי בעל ייחוס (אביו היה אחד מגדולי הכדורגלנים בכל הזמנים) - ג'ורדי קרויף. כמו כן לאחר הניסיון המר עם נמני ואיוניר החליט הבעלים שכל השדרה המקצועית במועדון תהיה זרה. הספורט מנג'ר ההולנדי מינה לתפקיד המאמן את חברו אוסקר גארסיה , שחקן עבר בברצלונה. כמו כן, התחזקה הקבוצה בתחילת העונה מבחינת זרים בשוער וינסנט אניימה, בבלמים קרלוס גרסיה וב-סטיב גוהורי בקשר גונסאלו גארסיה ובחלוץ רוברט ארנשואו. בגזרת הישראלים הובאו הבלם איתן טיבי והקשר מהראן ראדי. מנגד, כחלק מהמהפכה שוחררו גיא חיימוב, ניבאלדו בטיסטה סנטנה, סאבו פאביצ'ביץ', מדוניאנין, קונאטה, קלמי סבן, מאור בוזגלו וגיז'רמו ישראלביץ' ואילו ברק יצחקי נשלח לשנת גלות בקפריסין.
בעונה זו, הוקטן מספר הקבוצות בליגה מ-16 ל-14. הליגה כללה 14 קבוצות ששיחקו ביניהן במשך 2 סיבובים בני 13 משחקים כל אחד - 26 מחזורים בסה"כ.
לאחר מכן פוצלה הליגה לפלייאוף עליון (6 קבוצות ששיחקו ביניהן במשך 2 סיבובים בני 5 משחקים כל אחד) ותחתון (8 קבוצות ששיחקו ביניהן במשך סיבוב אחד בן 7 משחקים) שכללו תוספת של 10 ו7 מחזורים לעונה הסדירה בהתאמה ובסה"כ 36 ו-33 מחזורים בהתאמה.
המשחק הראשון בליגה זימן לצהובים מפגש קשה ומסקרן מול הקבוצה המובילה בארץ מאז תחילת שנות האלפיים עם 7 אליפויות ב-12 שנים, מכבי חיפה. הצהובים לא ניצחו את הירוקים בליגה ב-8 המפגשים האחרונים (מאזן של 7 נצחונות לירוקים ותיקו). כבר בדקה ה-7 מצא המגן עומר ורד את דאבור בתוך הרחבה וזה קבע 0-1 למכבי ת"א. לפני המחצית חיפה חזרה והשוותה ל-1-1. בדקה ה-55 בישל רפי דהן לדאבור את השני שלו שהעניק לצהובים ניצחון חשוב וסמלי 1-2.
כמו בעונה שעברה, גם בעונה זו צברה הקבוצה רצף של 4 נצחונות בפתיחה, ה-3 הנוספים היו:
מחזור 2 - 1-0 בחוץ על מכבי נתניה משער של אלירן עטר.
מחזור 3 - 3-1 בחוץ על הפועל חיפה משלושער של אלירן עטר.
מחזור 4 - 0-4 ביתי על האלופה היוצאת עירוני ק"ש משערים של גונזאלו גארסיה, אלירן עטר (2) ומהראן ראדי.
שוב כמו בעונה הקודמת הרצף נעצר במחזור ה-5 הפעם עם הפסד בב"ש 1-3 כשדאבור רק מצמק.
הקבוצה התאוששה מהר עם 3 נצחונות רצופים:
מחזור 6 - 1-2 משערים של דור מיכה ורוברט ארנשואו.
מחזור 7 - 2-0 משער עצמי ושער של אלירן עטר.
מחזור 8 - 1-3 משערים של אלירן עטר (2) ומהראן ראדי.
הפתיחה הנהדרת של 7 נצחונות ב-8 משחקים נעצרה עם שני הפסדים בדרבי הגדול (0-1) להפועל ת"א ובדרבי הקטן של ת"א (1-0) לבני יהודה.
במחזור ה-9 יצאה הקבוצה למשחק חוץ קריטי ברמת השרון. פתיחת המשחק לא בישרה טובות לצהובים. כבר אחרי 7 דקות עלו המקומיים ליתרון 0-1. חמש דקות להפסקה הוכפל היתרון ל-0-2. בתוספת הזמן של המחצית הצליח דאבור לצמק ל-1-2. עם פתיחת המחצית השנייה עלו המקומיים ליתרון 1-3 ונראה היה כי הצהובים בדרך להפסד שלישי רצוף ועונה נוספת שבה מכבי ת"א יוצאת מהמרוץ לאליפות בשלב מוקדם.
בדקה ה-64 צימק גונסאלו גרסיה בבעיטה מהאויר לפינה לאחר בישול של הקפטן שרן ייני. בדקה ה-75 בעיטה של ייני נהדפה היישר לעבר אלירן עטר שגלגל את השוויון פנימה, 3-3. 4 דקות לאחר מכן, בעיטת שוער ארוכה של אניימה מצאה את רוברטו קולאוטי לבד מול השער והחלוץ השלים את המהפך 4-3 למכבי ת"א. הקאמבק המטורף במשחק זה היה נקודת המפנה בעונה הזו.
במחזור ה-10 הביסה מכבי ת"א את בני סכנין 0-4 משערים של יואב זיו, אלירן עטר (2) ומואנס דאבור.
במחזור הסיום של הסיבוב הראשון התארחה מכבי ת"א באצטדיון רמת-גן במסגרת משחק רדיוס של בית"ר ירושלים. 26,000 צופים ראו את עטר מעלה את מכבי ל-0-1 אך הירושלמים השוו ל-1-1.
בסה"כ השיגה הקבוצה בסיבוב הראשון מאזן של 9 נצחונות, תיקו ו-3 הפסדים ודורגה במקום הראשון עם 28 נקודות כמו יריבתה העירונית הפועל ת"א.
בפתיחת הסיבוב השני הפסידה הקבוצה לירוקים מחיפה 0-1 וירדו מהפסגה. למזלם האדומים סיימו בתיקו ולא ניצלו זאת כדי לברוח.
במחזור הבא חזרה הקבוצה לפסגה תוך שהיא מנצלת תיקו נוסף של האדומים ומנצחת בעצמה את מכבי נתניה 1-2 משערים של אלירן עטר ורוברט ארנשאו.
במחזור ה-16 פתחו הצהובים פער של 4 נקודות בפסגה לאחר הצגה גדולה בבלומפילד בניצחון 2-6 על הפועל חיפה משערים של דאבור (2), ראדי, זיו, מרגוליס וייני. שערו של הקפטן היה אחד הבלתי נשכחים עם פצצה מ-25 מטרים למשקוף ופנימה.
בינואר התחזקה הקבוצה ב-2 שחקנים: ראדה פריצה וערן זהבי ששב מחו"ל. באותה תקופה היה זה רכש סנצסציוני מאחר וזהבי נחשב אז לסמל של האדומים ואף כבש את השער שהביא להפועל ת"א את האליפות והדאבל בעונת 2009/10.
עד לדרבי השיגו הצהובים 3 נצחונות ב-5 משחקים:
מחזור 18 - מכבי הביסה את הפועל ב"ש 0-5 משערים של סטיב גוהורי, אלירן עטר (2), מהראן ראדי ומשה לוגסי. יש לציין שבמשחק זה עצר השוער המחליף ברק לוי פנדל.
מחזור 20 - מכבי הביסה את הפועל עכו 0-4 משערים של דור מיכה שרן ייני ואלירן עטר (2)
מחזור 21 - מכבי מנצחת את הפועל ר"ג 1-0 משער של מהראן ראדי כשברק לוי שוב הודף פנדל ומציל את הקבוצה מאיבוד נקודות יקרות.
ה-11 בפברואר 2013 הוא תאריך שייזכר לשנים רבות בשל משחק הדרבי שהתקיים בו. לדרבי זה הגיעו הצהובים כשהם בפסגה ביתרון של 8 נקודות על הפועל ת"א ומכבי חיפה שדורגו ערב המחזור ה-22 במקומות ה-3 וה-2. מההתחלה היה ברור שהצהובים באו לדרוס. בדקה ה-13 שיתוף פעולה בין 2 שחקני הרכש ערן זהבי וראדה פריצה הביא לשער הבכורה של השבדי שקבע 0-1 למכבי. 2 דקות להפסקה בישל ראדי לעטר את ה-0-2. החלוץ השלים צמד בדקה ה-74 כשכבש את ה-0-3 בפנדל. בישול נוסף של זהבי הפעם לראדי הניב את תוצאת המשחק 0-4 למכבי שהשוותה בכך את 2 נצחונות השיא שלה בדרבי באותה התוצאה מעונות 1991/92 ו1992/93.
במחזור ה-23 ציפה לצהובים הדרבי הקטן מול הכתומים. בדקה ה-52 העלה פריצה את מכבי ליתרון 1-0. בני יהודה אמנם השוותה בדקה ה-74 אבל הדרמה האמיתית החלה בדקה ה-90. הכתומים ניצלו פציעה של ברק לוי כדי לעלות ליתרון 2-1 בדקה ה-90. הטיפול הארוך בשוער הביא לתוספת זמן ארוכה מצד השופט. עם חידוש המשחק, בדקה ה-93, כבש החלוץ השבדי את שערו השני במשחק והשווה את התוצאה ל-2-2. בדקה ה-98 הכדור הגיע למשה לוגסי שהניף רגל ומ-25 מטרים, בזווית אלכסונית, שלח את הכדור לחיבורים הרחוקים של איינוגבה. 2-3 מטורף למכבי תל אביב. ללא ספק, גול שכנראה הכריע את גורל האליפות.
עד תום הסיבוב השני השלימו הצהובים רצף של 7 נצחונות עם הנצחונות על הפועל רמה"ש (0-1, למכבי: עטר) ועל בני סכנין (3-0, למכבי: טיבי, פריצה וראדי) וההצגה מול בית"ר ירושלים (0-5, למכבי: זהבי , פריצה, עטר ודאבור (2).
בסה"כ השיגה הקבוצה בסיבוב השני מאזן של 10 נצחונות,תיקו ו-2 הפסדים ודורגה במקום הראשון עם 59 נקודות, 10 נקודות יותר מהדולקת אחריה מכבי חיפה.
בסיבוב הראשון של הפלייאוף השיגה הקבוצה מאזן של 3 נצחונות ו-2 תיקו:
מחזור 27 - 0-1 מול הפועל רמה"ש משער של פריצה.
מחזור 28 - 0-0 במשחק העונה מול מכבי חיפה.
מחזור 29 - 3-1 בקריית שמונה מול האלופה היוצאת משערים של דאבור, פריצה וזהבי.
מחזור 30 - 0-2 בדרבי מול הפועל ת"א משערים של זהבי (מהאוויר לאחר בישול של מיכה) ומיכה.
מחזור 31 - 2-2 מול הכתומים של בני יהודה. למכבי: זהבי (2).
ההפסד של הירוקים מחיפה לבני יהודה במחזור הפתיחה של הסיבוב השני של הפלייאוף, המחזור ה-32, נתן למכבי ת"א את ההזדמנות להבטיח אליפות ראשונה מזה 10 שנים אם תנצח את הפועל רמה"ש. 33ת000 אוהדים צבעו את אצטדיון רמת-גן בצהוב כמו בעונת 2002/03. בדקה ה-18 העלה דור מיכה את מכבי ליתרון 1-0. 12 דקות לסיום, כבש פריצה את השני וקבע את תוצאת המשחק 2-0 שהבטיחה למכבי ת"א את הזכייה באליפות המדינה בפעם ה-15 מקום המדינה וה-20 בתולדות המועדון.
חגיגות האליפות הרשמיות נערכו כעבור שבועיים כאשר 100,000 אוהדים גדשו את כיכר רבין כדי להודות לחבורת השחקנים והצוות המקצועי שהחזיר עטרה ליושנה.
מחזור אחד לתום הסיבוב השני של הפלייאוף, נפגשו הפועל ומכבי לדרבי הגדול של ת"א בפעם הרביעית לעונה זו. הפתיחה הייתה אדומה לחלוטין עם 0-2 כבר אחרי 22 דקות. דקה לסיום המחצית צימק זהבי בפנדל את התוצאה ל-1-2. בדקה ה-68 סובב ראדי בעיטה חופשית לחיבורים והשווה ל-2-2. קולאוטי שנכנס בדקה ה-81, כבש כעבור דקה והשלים מהפך ענק 3-2 לצהובים. בתוספת הזמן כבש מיכה את הרביעי וקבע את התוצאה 4-2 למכבי ת"א בדרבי. בפעם השנייה בעונה זו כובשת מכבי 4 שערים מול הפועל בדרבי.
בסיבוב השני של הפלייאוף השיגה הקבוצה מאזן של 3 נצחונות, תיקו והפסד ובסה"כ בכל שלב הפלייאוף 6 נצחונות, 3 תיקו והפסד וסיימה את העונה כאלופה עם 80 נקודות בפער של 13 נקודות מסגניתה מכבי חיפה.
מלך שערי הקבוצה והליגה בכלל היה אלירן עטר עם שיא אישי של 22 שערי ליגה. גם האחרים תרמו את חלקם: מואנס דאבור כבש 10 שערי ליגה, מהראן ראדי כבש 8 ובישל 11 שערים, ערן זהבי וראדה פריצה כבשו 8 ו-7 שערים בהתאמה ודור מיכה כבש 5 ובישל 3 שערים.
במשחקי גביע המדינה הודחה הקבוצה בפעם השביעית ברציפות לפני שלב רבע הגמר כאשר הפסידה בשמינית הגמר לבית"ר ירושלים, 2-0.
אליפות
