בתחילת העונה זו שיחקה הקבוצה במוקדמות ליגת האלופות. בסיבוב השני עברה הקבוצה את גיורי מהונגריה לאחר נצחון כפול בשני המשחקים: 2-0 משערים של יצחקי ואלברמן ו-1-2 משער עצמי ושער של טל בן חיים (החלוץ).

בסיבוב המוקדמות השלישי נתקלה הקבוצה באלופת שווייץ, פ.צ. באזל . במשחק הראשון בשווייץ ניצחו השווייצרים 0-1. גם הגומלין בת"א לא נפתח טוב מבחינת הצהבוים שנכנסו לפיגור 3-0 כבר לאחר 30 דקות של משחק. אבל דווקא אז החלה התעוררות גדולה. 3 דקות אחרי השער של השוויצרים ברק יצחקי בעט כדור שפגע במגן היריבה ונכנס פנימה, 3-1. 2 דקות לאחר מכן מבצע נהדר של ערן זהבי בתוך הרחבה הסתיים בבעיטה לשער, רק 3-2. בדקה ה-55 בעיטה של ראדי מ-20 מטרים מהאוויר קבעה 3-3 מדהים. כעת היו צריכים הצהובים להבקיע עוד 2 שערים כדי לעבור לשלב הבא אך לא הצליחו, הודחו ממוקדמות האלופות ונשרו לשלב הפלייאוף של הליגה האירופית.

מכבי הוגרלה לשחק נגד פאוק סלוניקי בשלב הפלייאוף, אך זו חזרה לליגת האלופות לאחר שיריבתה בסיבוב הקודם, מטאליסט חרקוב, הורחקה מליגת האלופות. לכן, ההעפלה השנייה בתולדות המועדון הצהוב לשלב הבתים של הליגה האירופית הייתה אוטומטית.

בשלב הבתים של הליגה האירופית, הוגרלה מכבי ת"א לבית יחד עם בורדו מצרפת, איינטרכט פרנקפורט מגרמניה ואפואל ניקוסיה מקפריסין, אותה כבר פגשה הקבוצה במסגרת מוקדמות גביע אופ"א בעונת 2005/06.

במשחק הראשון מול הקפריסאים החטיא יצחקי פנדל בדקה ה-93 והמשחק הסתיים ב-0-0.

במשחק השני הושג אחד הנצחונות הגדולים של הקבוצה באירופה עם 2-1 בצרפת משערים של ברק יצחקי ודור מיכה.

בצמד המשחקים מול הגרמנים הפסידו הצהובים במשחק הראשון בפרנקפורט 0-2 אך נתנו הצגה גדולה במשחק השני בבלומפילד, 2-4 משני צמדים של ברק יצחקי וערן זהבי כשכבר אחרי 30 דקות הוליכה מכבי 0-3.

במשחק החמישי מול אפואל ניקוסיה שוב סיימו הצהובים ב-0-0.

במחזור הסיום של שלב הבתים פגשה מכבי ת"א את בורדו במשחק ששוחק תחת גשם כבד ולא התעלה לרמה גבוהה, אך נגמר בניצחון צהוב בתוצאה 0-1 מפנדל מוצלח של ערן זהבי.

בסה"כ בקמפיין המוצלח ביותר שלה אי פעם באירופה צברה הקבוצה בשלב הבתים מאזן של 3 נצחונות, 2 תיקו והפסד והעפילה לשלב הבא מהמקום השני בבית עם 11 נקודות.

בשלב 32 האחרונות (אחד מהישגי השיא של הקבוצה באירופה) פגשה מכבי ת"א שוב את אותה פ.צ. באזל שהדיחה אותה 3 חודשים קודם לכן ממוקדמות ליגת האלופות. השוויצרים שסיימו בבית האלופות שלהם במקום ה-3 נשרו לליגה האירופית. במשחק הראשון שהתקיים בת"א סיימו הקבוצות בתיקו 0-0. דקות לפני תחילת משחק הגומלין בבירת שווייץ, נפצע אחד מכוכבי הקבוצה החלוץ ברק יצחקי במהלך החימום. במשחק עצמו הובסו הצהובים 0-3 והודחו מאירופה.

לאחר הזכייה בעונה הקודמת באליפות לראשונה מזה עשר שנים, עזב המאמן אוסקר גארסיה ובמקומו חתם בקבוצה, שחקן העבר הפורטוגלי של קבוצת הפאר יובנטוס ,פאולו סוזה. הרכש כלל את הזרים השוער חואן פאבלו קולינאס והקשר ניקולה מיטרוביץ'. בגזרת הישראלים הגיעו: עומרי בן הרוש, עומרי אלטמן, דן איינבינדר וטל בן חיים (החלוץ). במהלך חודש ינואר הצטרפו לקבוצה החלוץ ברק בדש והמגן רמי מארבאל ועזב החלוץ מואנס דאבור.

היתה זו עונה שלישית ברציפות שהקבוצה פתחה את הליגה עם רצף של 4 נצחונות:

מחזור 1 - 2-0 בעכו משערים של יצחקי וזהבי כבר אחרי 7 דקות.

מחזור 2 - 0-1 בדרבי הקטן מול בני יהודה משער של פריצה בדקה ה-92.

במחזור ה-3 יצאה הקבוצה למשחק חוץ בחיפה מול סגנית האלופה, מכבי חיפה, אותה לא ניצחה בחוץ כבר 9 שנים. במחצית השנייה, נתנו הצהובים הצגה והביסו את הירוקים 3-0 משער של יצחקי וצמד של פריצה. בפעם הראשונה מאז המחזור האחרון של עונת 2003/04, מכבי ת"א חוזרת מקריית אליעזר עם ניצחון על הירוקים.

מחזור 4 - 0-3 על עירוני ק"ש משערים של זהבי, דאבור וטל בן חיים (החלוץ).

שוב, כמו בעונות הקודמות נעצרה הקבוצה במחזור החמישי עם תיקו 0-0 באשדוד.

במחזורים ה-6 וה-7 ניצחה הקבוצה 0-1 את הפועל רמה"ש משער של זהבי והביסה את בני סכנין 1-4 משערים של זהבי (2), מיטרוביץ' (בבעיטה אדירה לחיבורים) ודאבור. לראשונה אחרי שישה משחקים הקבוצה סופגת.

למשחק העונה במחזור ה-8 בב"ש הגיעו הצהובים לאחר פתיחה מצוינת עם מאזן של 6 נצחונות ותיקו ב-7 משחקים 22 נקודות ומאזן שערים 1-14. מנגד, האדומים מהדרום שדורגו במקום ה-2 במרחק 8 נקודות מהפסגה היו חייבים ניצחון כדי שמכבי לא תברח לליגה. כבר אחרי 10 דקות העלה דאבור את הצהובים ל-1-0. המארחים מצידם ניצלו מצב נייח בדקה ה-31 כדי להשוות את התוצאה ל-1-1. בדקה ה-51 המארחים השלימו מהפך, 1-2. מכבי השוותה ל-2-2 תוך פחות מדקה עם שער טל בן חיים (החלוץ). אבל החותמת הסופית הייתה של האדומים שבדקה ה-73 עלו שוב ליתרון 2-3 והנחילו הפסד ראשון לצהובים.

שבוע לאחר מכן, הפער בפסגה צומצם עוד יותר כאשר הצהובים שהוליכו כבר 0-2 משערים של זהבי וניקולה מיטרוביץ' , ספגו 2 שערים ממכבי פ"ת שכפתה שוויון 2-2

עד לתום הסיבוב הראשון השיגה הקבוצה 4 נצחונות רצופים:

מחזור 10 - 3-1 מול הפועל חיפה משערים של בן הרוש, יצחקי וטל בן חיים (החלוץ).

מחזור 11 - 1-3 מול הפועל רעננה. הצהובים הוליכו 0-2 כבר אחרי 6 דקות משערים של דאבור וראדי. טל בן חיים (החלוץ) הוסיף את השלישי בדקה ה-75.

מחזור 12 - 2-1 בטדי משערים של פריצה (בדקה ה-2) ויצחקי שלא חגג מול קהל קבוצתו לשעבר.

מחזור 13 - 0-1 בדרבי מול הפועל ת"א - ערן זהבי כבש וקבע ניצחון צהוב רביעי רצוף בדרבי תוך שהוא חוגג לראשונה עם תנועת ה"פיו פיו" כנגד קהל קבוצתו לשעבר.

בסה"כ השיגה הקבוצה בסיבוב הראשון מאזן מצוין של 10 נצחונות, 2 תיקו והפסד ודורגה במקום הראשון עם 32 נקודות, 4 יותר מהדולקת אחריה הפועל ב"ש.

בפתיחת הסיבוב השני השעגה הקבוצה רצף של 3 נצחונות:

מחזור 14 - תצוגה גדולה בבלומפילד עם 0-5 על הפועל עכו משערים של ערן זהבי (2), דור מיכה, ראדה פריצה וגל אלברמן.

מחזור 15 - נצחון על הכתומים של בני יהודה 2-0 משערים של זהבי ופריצה.

מחזור 16 - הצהובים אירחו את הירוקים מחיפה לעוד משחק שנכנס לפנתיאון. עם פתיחת המחצית השנייה עלתה מכבי ליתרון 0-2 משערים של פריצה וייני. בדקה ה-64 צמצמו הירוקים ל-1-2. בדקה ה-70 התנהל מהראן ראדי עם הכדור במרכז המגרש והגביה אותו לרחבה. שם חיכה ברק יצחקי שהתרומם לגובה וכבש במספרת מדהימה את אחד השערים היפים ביותר שנראו אי פעם בארץ. בסיום ניצחה מכבי ת"א את מכבי חיפה 1-3 ופתחה ממנה פער של 17 נקודות(!!!).

שבוע לאחר מכן איבדו הצהובים גובה בפסגה עם הפסד בק"ש 1-3 (למכבי: זהבי).

עד למשחק העונה השני השיגו הצהובים רצף של 3 נצחונות על מ.ס. אשדוד, 0-2 (למכבי: שער עצמי וזהבי), על הפועל רמת השרון 3-0 (למכבי: מהראן ראדי, קרלוס גרסיה ודור מיכה), ועל בני סכנין 2-0 (למכבי: יצחקי ופריצה).

במחזור ה-21 אירחה מכבי ת"א את הפועל באר שבע למשחק העונה כשהפער ביניהן עמד על 3 נקודות בלבד. 12,000 צהובים ביציעים לא היו יכולים לצפות לפתיחה חלומית יותר כאשר כבר בדקה השלישית ראו את ראדה פריצה שולח טיל מהאוויר לרשת האורחים ומעלה את מכבי ליתרון 0-1. חמש דקות לאחר מכן הצהובים קיבלו הזדמנות פז להכפיל את התוצאה אך זהבי החמיץ מהנקודה הלבנה לאחר שמגן באר שבע הכשיל את פריצה וראה אדום. בדקה ה-34 השוו האורחים ל-1-1 אך המילה האחרונה במחצית הייתה שייכת לבלם מכבי קרלוס גרסיה שהעלה ליתרון 1-2. שער נוסף של יצחקי בדקה ה-65 קבע 1-3 (נצחון רביעי רצוף) ופתח פער של 6 נקודות בפסגה.

שבוע לאחר מכן ניצחו הצהובים בפ"ת 2-0 משערי בכורה של 2 שחקני הרכש של ינואר מארבאל ובדש אך במחזור ה-23 איבדו נקודות בתיקו 2-2 עם הפועל חיפה (למכבי: זהבי (2)).

עד לתום הסיבוב השני השיגו הצוהבים רצף של 3 נצחונות:

מחזור 24 - 2-0 על הפועל רעננה משערים של פריצה וקרלוס גרסיה (שער 3 של הבלם בעונה זו).

מחזור 25 - 0-1 על בית"ר ירושלים משער של פריצה.

מחזור 26 - במחזור הסיום של העונה הסדירה אירחה הפועל ת"א את מכבי ת"א לאחד ממשחקי הדרבי הדרמטיים והמרתקים ביותר אי פעם. יש שהגדירו דרבי זה כ"קרב האקדוחנים". בדקה ה-34 העלה ערן זהבי את מכבי ליתרון 1-0. 4 דקות אחר כך, הורחק פריצה והצהובים נותרו ב-10 שחקנים. 2 דקות לסיום המחצית השווה חלוץ הפועל עומר דמארי ל-1-1 וחגג כמו זהבי עם תנועת "פיו פיו". בדקה ה-87 נשרק פנדל לטובת הפועל, אותו ניצל דמארי כדי לבצע מהפך 1-2 ולהשלים צמד. בשלב זה הפער בפסגה הצטמצם לנקודה אחת בלבד מב"ש. כעבור 2 דקות נכנס טל בן חיים (החלוץ) כמחליף וכבר בנגיעה הראשונה סחט פנדל, אותו ניצל זהבי להשוות ל-2-2. נגמר? מה פתאום. 3 דקות בתוך תוספת הזמן, ייני קטע התקפה של המארחת והעביר את הכדור לבדש. החלוץ זיהה את זהבי בעומק שטח היריבה והאחרון שלח את הכדור לפינה ושלף את האקדחים. הספסל של הצהובים לא נשאר אדיש ואפילו פאולו סוזה זינק בספרינט כדי לחגוג עם הכובש. מכבי ניצחה דרבי חמישי ברציפות בליגה 3-2 עם שלושער ענק של זהבי ופתחה פער של 7 נקודות בפסגה.

בסה"כ צברה הקבוצה בסיבוב השני מאזן מצוין של 11 נצחונות, תיקו והפסד ודורגה במקום הראשון עם 66 נקודות.

בפתיחת הסיבוב הראשון של הפלייאוף, שבוע אחד בלבד לאחר הדרבי הקודם, התקיים דרבי נוסף מול הפועל ת"א והפעם נעצרו הצהובים עם תיקו 0-0 שהוריד את הפער בפסגה ל-5 נקודות.

במחזור ה-28 אירחה מכבי ת"א את הפועל באר שבע למשחק העונה ה-3. כמו במפגש הקודם, גם הפעם הצהובים עלו ליתרון מוקדם מאוד כאשר ברק בדש כובש אחרי דקה בלבד. בדקה ה-27 השלים החלוץ צמד וקבע את התוצאה 0-2 והפער בפסגה גדל ל-8 נקודות.

שבוע לאחר מכן סיימה מכבי בתיקו 2-2 עם השלישית בטבלה עירוני ק"ש (למכבי: זהבי (2)). במשחק הבא אירחו הצהובים את הירוקים מחיפה. דקה לסיום זה נראה מבטיח כשטל בן חיים הוכשל ברחבה ע"י קשר חיפה שהורחק אך ראדי החטיא את הפנדל. כשזה נראה אבוד, הגיע אלברמן וקבע בדקה ה-92 0-1 ופער של 11 נקודות למכבי ת"א בראש הטבלה.

במחזור האחרון של הסיבוב הראשון של הפלייאוף הפסידה מכבי ת"א לבני סכנין 1-2 כשפריצה רק מצמק. בסה"כ השיגה הקבוצה בסיבוב הראשון של הפלייאוף מאזן של 2 נצחונות, 2 תיקו והפסד ודורגה במקום הראשון עם 74 נקודות.

במחזור הפתיחה של הסיבוב השני של הפלייאוף הגיע הפסד ראשון בדרבי מול הפועל ת"א (1-3, למכבי: זהבי) לראשונה מזה 6 דרבים.

ערב המחזור ה-33 הפער בטבלה בין מכבי ת"א שבפסגה לבין הפועל ב"ש שבמקום השני עמד על 10 נקודות. המשמעות: ניצחון של הצהובים במשחק העונה ה-4 יבטיח אליפות עונה שנייה ברציפות. 19 שנה לאחר משחק האליפות ההוא של עונת 1994/1995, שוב ירדו אלפי אוהדים צהובים דרומה כדי לצפות בקבוצתם זוכה בכתר. כבר בדקה ה-12 העלה ערן זהבי את הצהובים ליתרון 1-0 בבעיטה מהאוויר לאחר בישול של דור מיכה. בדקה ה-31 הוכשל טל בן חיים (החלוץ) ברחבה וזהבי השלים צמד כשכבש את הפנדל והעלה ל-2-0. האדומים צימקו בדקה ה-84 וקבעו את תוצאת המשחק 2-1 שהבטיחה למכבי ת"א את הזכייה באליפות המדינה בפעם ה-16 מקום המדינה וה-21 בתולדות המועדון.

שבוע אחרי הזכיה באליפות אירחה האלופה הישנה-חדשה מכבי ת"א את מחזיקת הגביע הטרייה עירוני ק"ש. הצהובים ניצחו 1-3 משערים של דן איינבינדר, מיכה וזהבי. בסיום המשחק הוענקו צלחות האליפות הרשמיות לשחקנים.

3 ימים לאחר מכן, אירחו הירוקים את הצהובים למשחק האחרון אי פעם של אצטדיון קריית אליעזר. המשחק הסתיים בתיקו 2-2 כשזהבי כובש צמד לזכות מכבי ת"א.

במחזור האחרון של הפלייאוף הביסה מכבי ת"א את בני סכנין 1-4 משער של זיו ושלושער של זהבי.

בסה"כ השיגה הקבוצה בסיבוב השני של הפלייאוף מאזן של 3 נצחונות, תיקו והפסד ובשלב הפלייאוף כולו מאזן של 5 נצחונות, 3 תיקו ו-2 הפסדים וסיימה במקום הראשון עם 84 נקודות תוך שהיא משווה את השיא הישראלי לפער האלופה ממקום שני שעמד על 16 נקודות.

מלך השערים של הליגה בכלל ושל הקבוצה בפרט היה ערן זהבי שכבש 29 שערים, אחד פחות מהשיא נכון לאותה עונה והחל לבסס את מעמדו המיוחד בקבוצה ככוכב על. גם פריצה ויצחקי תרמו למלאכת הכיבושים עם 12 ו-7 שערי ליגה בהתאמה. על מלאכת הבישולים ניצח דור מיכה עם 9 בישולים. גם טל בן חיים (החלוץ) תרם את חלקו עם 4 שערים ו-5 בישולים.

בגביע המדינה הודחה הקבוצה לפני שלב רבע הגמר, עונה שמינית ברציפות, בסיבוב ח' מול מ.ס. אשדוד לאחר 1-2 בהארכה כשדאבור, במשחקו האחרון בקבוצה, מבשל לזהבי שער שוויון זמני בדקה ה-89.

עונת 2013/14

טבלת הליגה

משחקים